Comprendre l’épigénétique pour conserver la biodiversité
Connaissez-vous le rivulus ? Il s’agit d’un petit poisson qui vit dans les caraïbes, et qui possède des caractéristiques étonnantes. Il est en effet capable de s’autoféconder ! Mais dans ce cas, que devient la diversité génétique, indispensable à l’évolution d’une espèce ? Reportage dans les mangroves de Floride et du Bélize à la recherche d’une réponse.
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De l'escargot namurois à celui des Galapagos, il n'y a qu'un pas !
Une équipe internationale de chercheurs, dont le Prof Frederik De Laender, de l’Université de Namur, publient dans Nature Communications. L’éditeur prestigieux souligne que les auteurs utilisent des modèles théoriques et des données de terrain pour montrer comment les processus éco-évolutifs peuvent forcer les espèces à développer plus de traits caractéristiques similaires dans des communautés plus riches en espèces pour éviter la concurrence. Ce qui va à l’encontre de ce que nous percevons intuitivement. Explications.
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Des scientifiques de 33 pays européens unissent leurs forces pour générer des génomes de référence de près d’une centaine d’espèces européennes
Dans une nouvelle publication, l'Atlas européen du génome de référence (ERGA) annonce le succès de son projet pilote. Cette initiative pionnière a rassemblé un vaste réseau collaboratif de chercheurs et d'institutions dans 33 pays pour produire des génomes de référence de haute qualité de 98 espèces européennes. Cet effort continental ouvre la voie à un nouveau modèle de génomique de la biodiversité, inclusif et équitable.
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ERGA, un « Atlas européen des génomes de référence » pour préserver la biodiversité
Alors qu'environ un cinquième des quelque 200 000 espèces européennes sont menacées d'extinction, des chercheurs namurois participent à un consortium paneuropéen afin d’agir rapidement pour générer des ressources génomiques complètes de haute qualité à grande échelle.
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La biodiversité des rivières américaines analysée pendant 30 ans
Une équipe de chercheurs américains, avec l’aide de Frédérik De Laender, professeur au Département de biologie de l’UNamur, vient de publier dans la prestigieuse revue Nature. Leur étude décrit comment l’évolution des températures des cours d’eau et les introductions de poissons par l’humain peuvent modifier la biodiversité des rivières aux États-Unis.
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Un environnement de recherche de qualité grâce au NARC
Chaque début d’année académique, le Conseil d’administration octroie un statut de « Fellow NARC » à des chercheurs faisant preuve d’un CV de recherche de haut niveau, ayant reçu récemment un prix ou un financement prestigieux. Retour sur le fellowship du Professeur Frederik De Laender.
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Cartographier la vie
En 2021, l’Union européenne s’est lancée dans un chantier titanesque : sauvegarder le génome de toutes les espèces eucaryotes en Europe. Soit l’ensemble du vivant, à l’exception des bactéries et des archées (micro-organismes). Dénommé ERGA, pour European Reference Genome Atlas, et auquel participe l’UNamur grâce à la professeure Alice Dennis, ce projet espère ainsi participer à la sauvegarde de la biodiversité, alors même qu’un cinquième des espèces européennes sont en danger d'extinction.
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21 nouveaux financements F.R.S.-FNRS pour la recherche à l’UNamur
Le F.R.S.-FNRS vient de publier les résultats de ses différents appels 2024. Appels équipement, crédits et projets de recherche, bourses de doctorat FRIA et Mandant d’Impulsion Scientifique (MIS), les instruments sont nombreux pour soutenir la recherche fondamentale. Découvrez les résultats de l’UNamur en détail.
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École d’été – L’écrit diplomatique médiéval
Prioritairement adressée aux étudiants de master et aux doctorants, cette formation visera à accompagner les participants selon une logique progressive dans l’assimilation des fondamentaux de la science diplomatique. À cette fin, elle mêlera des cours magistraux dispensés par des membres de l’équipe, des temps de rencontre et d’échange avec des spécialistes internationalement reconnus de la discipline, et des exercices pratiques sur des corpus documentaires inédits conservés aux Archives de l’État à Namur.
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Catherine Linard lauréate du mandat de Professeur de Recherche Francqui-Collen pour ses recherches sur la propagation des maladies infectieuses
Catherine Linard, chercheuse du Département de géographie de l’UNamur, a été récompensée pour ses travaux à la croisée de la géographie et de l’épidémiologie. Ce mandat Francqui-Collen lui permettra, dès septembre et pendant trois ans, d’être déchargée de la majeure partie de ses enseignements afin de se consacrer davantage à ses recherches sur l’influence des changements environnementaux sur propagation des maladies infectieuses.
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Soutenance publique de thèse de doctorat en Sciences chimiques - Lou D'haese
RésuméIn this work, I aimed at simulating accurately the Raman optical activity (ROA) signatures of flexible solute molecules in their environment. Indeed, these systems are quite challenging due to potentially huge number of conformers, i.e. local minimum on the potential energy surface (PES). Moreover, the environment can drastically change the PES which can be observed on the experimental ROA spectra that vary quite a lot with the conformation of the molecule and its surroundings. In order to tackle this issue, we have designed a hierarchy of methodology named M1, M2, M3. In M1 and M2, the so-called static approach is used: one or more conformers are found, their geometry are reoptimized at the Density Functional Theory (DFT) level, and their vibrational signatures are simulated, usually at the harmonic approximation. The initial list of conformers was obtained by using the CREST algorithm. In M1, the solvent is considered implicitly while in M2, explicit solvent molecules are added around the solute molecule. In M3, we perform an ab-initio molecular dynamics of the solute molecule surrounded by explicit solvent molecules. The spectrum is obtained by evaluation time-correlation functions along the trajectory. Our first systems of interest were cryptophane derivatives. They are flexible cage-like systems made of two hemispheres connected by three -O-(CH2)n-O- (denoted Cr–nnn) linkers that exhibit chiroptical properties. For Cr–111, the smallest cryptophane possible, M1 methodology gave a good agreement with respect to experiment, especially in the fingerprint region. However, we have demonstrated that the relative ratio between the different conformers was strongly impacted by the choice of the exchange-correlation (XC) functional in our DFT calculations demonstrating the sensibility of the description of the PES. Cr–222 molecules have shown to be more flexible, as demonstrated by a greater number of significant conformers. The overall agreement with experiment was also satisfactory. Finally, to test our different approaches (M1-M3), I have performed new ROA measurements of amino acids in water at the University of Bordeaux in the lab of Dr. Daugey. When compared to our simulations, we have clearly seen an improvement on the ROA signatures when explicit water molecules are added in our simulations (M2 vs M1). Unfortunately, M3 method did not perform as expected and further investigations are needed. Overall, I have shown that the PES as described by our various methodologies is very sensitive to various parameters of the simulation such as the XC functional, the number and position of explicit solvent molecules, … and that all these impact strongly the simulated ROA signatures.JuryProf. Francesca CECCHET (UNamur), PrésidenteProf. Vincent LIÉGEOIS (UNamur), SecrétaireProf. Benoît CHAMPAGNE (UNamur)Prof. Carine CLAVAGUÉRA (Université Paris-Saclay)Dr Nicolas DAUGEY (Université de Bordeaux)
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Soutenance publique de thèse de doctorat en sciences biologiques - Arunima Sikder
RésuméEnvironmental change rarely arrives as a single, isolated event; organisms and communities typically experience one stressor against the backdrop of another already passed. Arunima Sikder's doctoral thesis asks whether an organism's past environment shapes its response to the environment that follows, and whether that influence propagates upward to affect the stability of the communities these organisms belong to.The thesis addresses this question in Synechococcus sp., a globally significant marine primary producer, using thermal and chemical stressors as its two environmental drivers. Working across three levels of biological organisation, the work accounts for how past environments shape responses to subsequent ones arriving in sequence, in fluctuation, or in combination — with functional traits as the common currency for measuring these responses.The results show three things. First, sensitivity to a stressor depends on the sequence of exposure, not on the stressor alone. Second, response diversity predicts community stability only when measured under the community's actual acclimation history, rather than under sustained conditions as convention assumes. Third, an apparent contradiction of biodiversity–ecosystem-function theory — a negative relationship between functional diversity and performance.Together, these findings argue that sensitivity, response diversity, and functional diversity should be treated as state-dependent quantities rather than fixed properties, with consequences for how the performance of biological systems is measured and modelled under increasingly variable environmental regimes.JuryProf. Alice DENNIS (UNamur), PrésidenteProf. Frederik DE LAENDER (UNamur), SecrétaireProf. Maren STRIEBEL (Carl-von-Ossietzky University Oldenburg)Prof. Giulia GHEDINI (Monash University)Prof. Eli THORÉ (UNamur)
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