Acquis d'apprentissage

Au terme de son apprentissage, l’étudiant sera en mesure de:

  • Utiliser de manière appropriée les appareillages et le matériel de laboratoire utilisés en biochimie (balance, pH-mètre, spectrophotomètre, centrifugeuse, pipette, micropipette, cuvette spectrophotométrique, plaque 96 puits, papier pH, pipette Pasteur, verrerie, colonne de séparation, filtre).
  • Préparer une solution d’une concentration définie à partir d’une poudre ou d’un liquide.
  • Réaliser une dilution.
  • Préparer une solution tampon et comprendre son utilité.
  • Réaliser une droite d’étalonnage et un dosage spectrophotométrique.
  • Quantifier l’activité d’une enzyme par dosage spectrophotométrique d’un produit ou substrat.
  • Purifier une protéine d’intérêt par chromatographie par échange d’ion et centrifugation différentielle.
  • Rédiger un compte-rendu d’expérience.
  • Analyser des données brutes expérimentales et les présenter en utilisant un tableur (Excel).
  • Interpréter des données expérimentales et émettre un avis critique sur celles-ci.
  • Développer une capacité de gestion optimale du temps et du travail en binôme.
  • Restituer le nom, le code 1 lettre, le code 3 lettres, la structure, le pKa et la classe (selon la polarité de la chaîne latérale) des acides aminés.
  • Restituer les caractéristiques de la liaison peptidique et savoir dessiner un peptide avec une ionisation correcte en fonction d’un pH défini.
  • Restituer les niveaux de structure des protéines.
  • Comprendre et restituer les principes théoriques des techniques de séparation suivantes: chromatographie par échange d’ion, électrophorèse et chromatographie d’exclusion moléculaire.
  • Connaître les 3 linéarisations utilisées en enzymologie et savoir calculer les constantes cinétiques enzymologiques à partir de ces linéarisations.
  • Identifier le type d’inhibition d’un inhibiteur enzymatique à partir de son impact sur les constantes cinétiques.
  • Elaborer un protocole de dosage enzymologique en choisissant le matériel et la méthode adéquate pour sa réalisation.

Contenu

Seront abordés dans ce cours: 
  • Préparation de solutions et exercices de spectrophotométrie.
  • Caractéristiques structurales des acides aminés et des protéines.
  • Caractéristiques chimiques et techniques de séparation des acides aminés et des protéines.
  • Exercices d’enzymologie.
  • Mise au point d’un protocole d’enzymologie : étude de la cinétique enzymatique de la phosphatase alcaline.

Prérequis

Chimie organique [MCHIB107]

Corequis

Biochimie générale [MPHAB202]

Méthodes d'enseignement

L'étudiant aura à sa disposition:

  • Un syllabus de travaux dirigés.
  • Un syllabus de travaux pratiques.
  • Les supports powerpoints utilisés lors des séances de travaux dirigés.
  • Des vidéos illustrant des points théoriques et/ou pratiques.

Les séances de travaux dirigés ont pour objectif de voir la matière théorique et pratique nécessaire au bon déroulement et à la bonne compréhension des séances de travaux pratiques et au traitement des résultats générés durant ces séances. 

Méthode d'évaluation

L’UE comporte deux volets : un volet pratique et un volet théorique.

Volet pratique

Le volet pratique comprend une séance d’introduction et un premier TP (TP1), qui ne sont pas évalués, ainsi que trois TP évalués (TP2, TP3 et TP4). L’évaluation repose sur les interrogations d’entrée, les rapports de fin de TP et un examen pratique organisé hors session.

La note du volet pratique est répartie comme suit :

  • TP2 : 15 % ;

  • TP3 : 15 % ;

  • TP4 : 15 % ;

  • examen pratique hors session : 55 %.

La présence aux séances de TP est obligatoire. En cas d’absence à plus d’une séance, l’étudiant·e ne sera pas autorisé·e à présenter l’examen pratique hors session. Cet examen n’est organisé qu’en première session et ne peut pas être représenté en troisième période.

Volet théorique

Le volet théorique comprend des travaux dirigés (TD) et un examen théorique organisé en session. Cet examen constitue l’intégralité de la note du volet théorique.

Modalités d’évaluation en première session

En première session, la note finale de l’UE correspond à la moyenne pondérée des deux volets :

  • volet pratique : 40 % ;

  • volet théorique : 60 %.

Pour valider l’UE, l’étudiant·e doit obtenir une note d’au moins 10/20 dans chacun des deux volets. Si la note obtenue à l’un des volets est inférieure à 10/20, la note finale de l’UE est plafonnée à 8/20, quelle que soit la moyenne pondérée obtenue.

Modalités d’évaluation en troisième période

En troisième période, seul l’examen théorique peut être représenté. La note obtenue à cet examen constitue alors l’intégralité de la note finale de l’UE. La note du volet pratique et la pondération appliquée en première session ne sont donc plus prises en compte.

 

Langue d'enseignement

Français