Acquis d'apprentissage

A la fin du cours, l'étudiant doit être capable :
 
- Identifier les capacités métaboliques d'une bactérie donnée à partir de son donneur et de ses accepteurs électroniques.
- Connaître les principales enzymes impliquées dans les voies évoquées
- Connaître les caractéristiques fonctionnelles et structurelles régulant les métabolismes bactériens (ex. carboxysomes, hétérocystes, etc.).
- Connaître des exemples d'interactions symbiotiques métaboliques.
 

Objectifs

Fournir un aperçu de la grande diversité métabolique des bactéries dans le contexte de leur environnement et des méthodes d'étude du métabolisme bactérien et des écosystèmes microbiens.
Être capable d'identifier les voies métaboliques d'un micro-organisme donné (naturel ou hypothétique) à partir des résultats d'expériences.
  Proposer des méthodes pour étudier le métabolisme et les communautés bactériennes.
Concevoir un écosystème simple.
 

Contenu

Types nutritionnels
Phototrophie
Autotrophie
Fixation biologique du diazote
Chimiotrophie
Fermentation
Respiration anaérobie
Acétogénèse
Méthanotrophie
Synthrophie
Méthodes pour étudier le métabolisme bactérien
Méthodes d'étude des communautés microbiennes
Écosystèmes microbiens
 

Table des matières

Types nutritionnels

Phototrophie

Autotrophie

Fixation biologique du diazote

Chimiotrophie

Fermentation

Respiration anaérobie

Acétogénèse

Méthanotrophie

Synthrophie

Méthodes pour étudier le métabolisme bactérien

Méthodes d'étude des communautés microbiennes

Écosystèmes microbiens

 

Méthodes d'enseignement

Le cours est donné sous forme (1) de cours magistraux, (2) lectures d'articles et (3) TPs.

Méthode d'évaluation

L'évaluation sera continue :


  • Examen oral à la dernière séance de cours (50 %) : la discussion orale peut porter sur un problème ou sur un ou deux articles scientifiques. Elle consiste à analyser le métabolisme d’une bactérie hypothétique, à partir de voies et/ou énoncés métaboliques, à reconnaître des structures intracellulaires et/ou des enzymes participant à des étapes clés, à proposer des méthodes pour étudier un écosystème donné, ou à expliquer les bases métaboliques des interactions symbiotiques entre micro-organismes. Une sélection de problèmes ou articles sera proposée aux étudiants deux semaines avant l’examen oral.
  • Travaux pratiques (TP) (30 %) : discussions et rapports réalisés durant les séances.
  • Participation aux discussions d’articles scientifiques en classe (15 %).
  • Participation en classe (5 %).

Il n'y a pas d'examen pendant les sessions (juin ou août).

L’examen oral consiste en une discussion sur le métabolisme d’une bactérie, basée sur des voies et/ou énoncés métaboliques, ainsi que sur la reconnaissance de structures intracellulaires et/ou d’enzymes participant à des étapes clés des voies métaboliques, ou sur la proposition de méthodes pour étudier un écosystème donné, et/ou sur l’explication des bases métaboliques des interactions symbiotiques entre micro-organismes. Sinon, l’examen oral peut porter sur un ou deux articles scientifiques liés à un ou plusieurs chapitres abordés durant le cours.

Les étudiants se verront proposer une sélection de problèmes ou d’articles deux semaines avant l’examen oral.

Toutes les évaluations donnent accès au livre et aux notes, mais sans accès à Internet.

Sources, références et supports éventuels

Brock Biology of Microorganisms

Langue d'enseignement

Anglais
Formation Programme d’études Bloc Crédits Obligatoire
Bachelier en sciences biologiques Standard 0 3
Bachelier en sciences biologiques Standard 3 3