Au terme du cours, l'étudiant(e) sera familiarisé avec le monde bactérien, tant du point de vue de la structure cellulaire et du métabolisme des bactéries que du point de vue des rôles joués par les bactéries dans les divers écosystèmes qu'elles ont colonisé. Un aperçu des pathologies d'origine bactérienne et des traitements possibles sera aussi acquis par l'étudiant(e).
Le cours de Bactériologie va s’appuyer sur le rôle des bactéries dans les processus évoqués dans d’autres cours, comme le métabolisme et le recyclage des matières. L'étudiant(e) connaitra la structure générale des bactéries et de leurs appendices, les principes de base des métabolismes bactériens, différents modes de vie bactériens, l'établissement des communautés bactériennes et la génération de pathologies d'origine bactérienne.
Les transferts horizontaux de gènes et la génétique bactérienne sont évoquées dans d’autres cours, Génétique (Bloc 2 Biologie) et Compléments de génétique (Bloc 3 Biologie).
Le cours sera divisé en quatre parties, illustrées des démonstrations intégrées au cours tels que la mise en culture et l’observation de bactéries au microscope.
- Structure et fonctions des cellules bactériennes
- Métabolismes bactériens et recyclage des matières
- Communautés bactériennes : microbiomes, biofilms et cultures
- Introduction à la pathogénie bactérienne
Des travaux pratiques sont proposés pour apprendre la mise en culture et l'observation des bactéries.
Introduction générale
Les cellules bactériennes : structures et fonctions
- forme et taille des cellules
- la membrane cytoplasmique
- la paroi et l'enveloppe
- appendices
Métabolismes bactériens
- conservation de l'énergie et catégories nutritionnelles
- petit rappel de bioénergétique, respirations et fermentations
- réductions dissimilatives et assimilatives
- photosynthèses et fixation du carbone
- fixation de l'azote et cycle de l'azote
Modes de vie bactériens
- exemples de modes de vie
- biofilms
- microbiomes
- phages
- cultures bactériennes
Pathogènes bactériens
- définitions
- adhérence
- virulence
- pathogènes extracellulaires et intracellulaires
- systèmes de sécrétion
- enzymes et toxines
- les antibiotiques
- résistance aux antibiotiques, tolérance et persistance
Des démonstrations seront réalisées au cours afin d'illustrer des points importants de la matière. Deux séances de travaux pratiques sont organisées.
Le cours se donnera en auditoire et sera émaillé de démonstrations pratiques des principes clés vus en théorie. Des travaux pratiques (2 séances et des prélèvements à effectuer dans la nature) sont organisés.
L'évaluation prendra la forme d'un examen oral, dont le but sera d'évaluer les connaissances de base de l'étudiant(e) sur les différents aspects de la bactériologie qui auront été vus au couyrs, y compris les démonstrations et les travaux pratiques. L'étudiant, après avoir pris connaissance de ses questions, disposera d'un temps de préparation (environ 30 minutes) et sera ensuite amené à présenter sa réponse, si possible accompagnée de schémas clairs et précis.
Une copie des dias en PDF sera disponible au fur et à mesure de la progression du cours. Entretemps, les dias de l'année précédente sont disponibles sur Webcampus.
L'ouvrage de référence est "Biologie des micro-organismes" (Brock), Ed. Pearson. Disponible à la BUMP (en anglais).
| Formation | Programme d’études | Bloc | Crédits | Obligatoire |
|---|---|---|---|---|
| Bachelier en sciences biologiques | Standard | 0 | 2 | |
| Bachelier en sciences biologiques | Standard | 2 | 2 |