Soutenance publique de thèse - Virgile NEYMAN
Caractérisation de la tréhalase d’Acyrthosiphon pisum en vue de la conception de nouveaux insecticides
RésuméLes pucerons sont des ravageurs majeurs dans l'agriculture, causant des dommages directs aux plantes et agissant comme vecteurs de virus phytopathogènes. Les insecticides conventionnels sont largement utilisés pour les contrôler, mais leur toxicité et leur efficacité posent problème au niveau de l’environnement, sur la santé humaine et avec l’apparition de résistances à ces composés. Ainsi, de nouvelles alternatives sont nécessaires, telles que le contrôle biologique avec l’utilisation de prédateurs ou de parasitoïdes. Cependant, ces méthodes ne sont pas toujours économiquement viables à grande échelle. Dans le cadre de cette thèse, une autre approche est explorée et qui consiste à développer de nouveaux insecticides ciblant les fonctions biochimiques des pucerons.Le projet vise à découvrir de nouveaux inhibiteurs de la tréhalase, une enzyme essentielle pour le métabolisme énergétique des insectes. L'inhibition de cette enzyme pourrait perturber les fonctions vitales des insectes sans affecter les mammifères. Cette recherche s’est déroulée en plusieurs étapes : la purification et la caractérisation complète de la tréhalase d’Acyrthosiphon pisum (le modèle de cette étude), l’analyse in vivo, in vitro et in silico d’inhibiteurs commerciaux sur cette enzyme, avant de passer à la recherche de nouveaux inhibiteurs. Deux points de la lutte intégrée contre les insectes ont été explorés, le contrôle biologique et le contrôle chimique.Le côté biologique a vu l’étude d’une souche de Streptomyces produisant naturellement des métabolites inhibiteurs de la tréhalase, notamment la validamycine A, molécule reconnue dans la littérature comme l’un des meilleurs inhibiteurs, mais non applicable en tant qu’insecticide. D’autres molécules semblent présenter des traits intéressants, mais sans avoir pu réussir à les isoler et les caractériser.Le côté chimique a permis de créer une hypothèse pharmacophore sur base de résultats expérimentaux sur des molécules obtenues par criblage virtuel. Bien que ces molécules ne soient pas utilisables en l’état en tant qu’insecticides, cette hypothèse permet de mieux comprendre les inhibiteurs de tréhalase en général et pourra être utilisée afin d’affiner les analyses futures. JuryProf. Jean-Yves MATROULE (UNamur), présidentDr Catherine MICHAUX (UNamur), promotrice et secrétaireProf. Frédéric FRANCIS (ULiège), co-promoteurProf. André MATAGNE (ULiège)Dr Rudy CAPARROS (ULiège)Dr Morgan HANS (Biocidal)
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Mercredi des Savoirs : les couleurs - mais d'où viennent-elles ?
Les couleurs - mais d’où viennent-elles ?
Saviez-vous que la couleur de vos bonbons rouges favoris était réalisée à partir de petites chenilles ? Accompagnés par une archéologue, vos enfants plongent dans l’histoire en découvrant les différents matériaux à l’origine des couleurs utilisées dans la peinture. Ils pourront tester des recettes anciennes de plusieurs siècles et peintre leur propre enluminure.Des ateliers ludiques pour les enfants Des ateliers aux thématiques variées de pédagogie active au cours desquels vos enfants vont développer leur sens de l’observation, d’analyse et leur esprit critique à travers des expériences, des jeux scientifiques et des découvertes extraordinaires. En pratiqueÀ qui s’adresse les ateliers ? Les ateliers s’adressent aux enfants entre 9 et 12 ans. Le nombre d’enfants par atelier est limité afin de garantir un apprentissage optimal (12 enfants). L’atelier se déroule si minimum 5 enfants sont inscrits. Comment se déroule les ateliers ? Les ateliers sont organisés un mercredi après-midi par mois de 14h à 16h à l’Université de Namur. La participation à un atelier coûte 5€ par enfant. Ce prix comprend l’encadrement, le matériel et une collation. Il est possible d’inscrire vos enfants à plusieurs ateliers ou à tous les ateliers et ainsi profiter d’un tarif avantageux. Les réservations sont clôturées 15 jours avant la date de l’activité. Attention : tarif préférentiel pour les enfants du personnel de l'UNamur (code de réduction : PromoUNamur).Vos enfants sont pris en charge et accompagnés par une équipe d’animateurs. Qui organise les ateliers ? Les ateliers sont organisés par le Confluent des Savoirs, la cellule de sensibilisation et de diffusion de la recherche de l’UNamur. L’équipe, experte en transmission des savoirs, travaille en collaboration avec les chercheurs de l’université pour proposer des ateliers lors desquels vos enfants se questionnent, réfléchissent et expérimentent tout en s’amusant !
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Soutenance publique de thèse - Doux BARAKA KUSINZA
Sujet de la dissertation
Essays on women's (dis)advantages in access to resources.Composition du Jury :Prof. Catherine Guirkinger - Promotrice (UNamur)Prof. Lorenzo Trimarchi - Président du Jury (UNamur)Prof. Jean-Marie Baland (UNamur)Prof. Jordan Loper (Université de Clermont-Ferrand)Prof. Julia Vaillant (Banque Mondiale)
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Fête de la Musique au Quai22
La Fête de la Musique à Namur , c'est un peu plus d'une vingtaine de concerts gratuits du 20 au 23 juin, tous styles de musiques confondus, qui invitent le public à papillonner, l'esprit ouvert et l'oreille curieuse d'un lieu culturel à un jardin, une cour, une terrasse de café, une boutique, en quête d'univers musicaux variées, tantôt festifs, tantôt plus feutrés, voire singuliers. C'est un projet de proximité qui vise à retrouver l'esprit original de la Fête de la Musique : une ambiance chaleureuse, de belles rencontres et un partage spontané entre les musiciens et le public.Le 22 juin, Venez découvrir le projet namurois Orphée.Librement inspiré du mythe éponyme, ce projet namurois se réapproprie l’histoire pour en faire une forme musicale inédite : à mi-chemin entre techno, classique, ambient et field recording. Il puise son inspiration à la source de la musique électronique tant primitive que contemporaine. Les électrodes qui captent les variations de potentiel électrique des plantes génèrent une musique expérimentale et improvisée. L’électricité enflamme les circuits électroniques des modules, l’énergie exalte les plantes et l’amour électrise Orphée. En résulte une musique unique, puissamment organique et aventureuse.Mix & Live analog visuals by Analog Memory aka François Gustin - Mythe d'Orphée adapté par Julie Csik & Benoît VermerL'événement est gratuit !Plus d'informations ici.
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Soutenance publique de thèse - Sébastien MEURANT
Sujet de thèse
Use of BioID within mitochondria: examples with the study of human mitochondrial co-translational import process and with the identification of MPV17 function
Résumé
This thesis was divided in two different parts dedicated to the study of a mitochondrial process and of a mitochondrial protein using a proximity labelling assay called BioID. The first project was dedicated to the study of a poorly characterized process, the mitochondrial co-translational import. In this process, translation is coupled to the translocation of the mitochondrial proteins, alleviating the energy cost typically associated with the post-translational import relying on chaperone systems. However, the mechanisms are still unclear with only few actors identified but none that have been described in mammals yet. We thus profiled endogenously the TOM20 proxisome using BioID. Despite the enrichment of RNA binding proteins in the TOM20 proxisome, we could not demonstrate a role for a selected candidate, LARP4, in the mitochondrial co-translational import process. Nonetheless, additional uses of this BioID cell line were highlighted such as the monitoring of protein entry inside mitochondria and a potential application in the prediction of mitochondrial protein half-life.The second project was dedicated to the study of MPV17, a protein of the inner mitochondrial membrane whose gene is associated with mitochondrial DNA depletion syndrome. However, the exact molecular function of the protein is still unclear. The approach used in this project was to identify the interacting partners of MPV17, using BioID, to get additional clues about the protein function. In this project we demonstrated an interaction of MPV17 with the MICOS complex but the KO of MPV17 didn’t impact mitochondria ultrastructure. However, the depletion of MPV17 protein led to increased mitochondria-derived vesicles formation. Therefore, we investigated a potential degradation of the mtDNA as the cause of the mtDNA depletion observed in MPV17 KO cells but, despite a higher mitophagy level in KO cells, the blockade of the lysosomal activity didn’t prevent the depletion. Additional in silico analyses suggested a channel activity of MPV17 further supported by its direct interaction with the Cyclophilin D, a protein of the mitochondrial permeability transition pore. Interestingly, MPV17 KO cells also display higher level of mitochondrial calcium which would be related to the degradation of the mtDNA since the blockade of mitochondrial calcium entry prevents the depletion. We thus propose a role of MPV17 as a potential new member of the mitochondrial permeability transition pore whereas in the absence of the protein, the build-up of calcium inside the mitochondria would lead to the observed mtDNA degradation.
Jury
Prof. Benoît MUYLKENS (UNamur), présidentProf. Patsy RENARD (UNamur), promotrice et secrétaireProf. Thierry ARNOULD (UNamur), co-promoteurProf. Dr. David PLA-MARTIN (Heinrich Heine University Düsseldorf, Germany)Dr Timothy WAI (Institut Pasteur de Paris, France)Prof. Guy LENAERS (Université d’Angers, France)Prof. Sven EYCKERMAN (Universiteit Gent)
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Narilis annual meeting
NARILIS is pleased to invite its members from UNamur and CHU UCL Namur to come together on December 17, 2024, for an exciting afternoon of scientific exchange. The program will run over an afternoon, and will feature many scientific talks and a "speed dating" poster session. The day will end with a festive walking dinner to celebrate all the successes of the year!This event is a fantastic opportunity to showcase your research. We encourage all researchers and clinician-researchers to actively participate and submit their communication proposals. Here’s how you can get involved:20-min talks in duo, trio or quatuor“My thesis in 5 minutes”Posters
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Soutenance publique de thèse de doctorat - Julien FAVRESSE
La COVID-19 est une maladie infectieuse causée par le SARS-CoV-2. La COVID-19 a été rapidement déclaré comme étant une pandémie par l'Organisation mondiale de la santé (OMS) le 11 mars 2020.Au début de la pandémie, les professionnels de la santé ont été confrontés à la commercialisation de nombreux kits conçus pour mesurer les anticorps de liaison. Le rôle des anticorps neutralisants comme meilleur corrélat de protection contre l’infection par le SARS-CoV-2 a rapidement été mis en lumière. Un test de neutralisation avec usage de pseudovirus a donc été développé par notre équipe et comparé à plusieurs tests de liaison.Des efforts considérables ont été déployés pour produire et valider cliniquement de nouveaux vaccins contre la COVID-19. L'étude CRO-VAX HCP est une étude conçue pour évaluer la réponse humorale dans une population de professionnels de santé ayant reçu deux doses du vaccin COVID-19 BNT162b2.Compte tenu de la diminution de l’efficacité du vaccin au fil du temps et de l’émergence de variants susceptibles d’échapper à l’immunité, une troisième dose a rapidement été recommandée par les autorités pour renforcer l’immunité. Celle-ci a été administrée à 155 volontaires de l’étude CRO-VAX HCP.Faisant toujours face à une diminution de l'efficacité vaccinale avec le temps et à l’émergence de nouveaux variants, un deuxième rappel adapté a été proposé. En septembre 2022, 54 participants de l'étude CRO‐VAX HCP ont reçu ce deuxième rappel. La réponse humorale a été évaluée et les anticorps neutralisants contre plusieurs variants ont été mesurés. De plus, nous avons également mesuré la réponse cellulaire au moyen d'un test de libération d'interféron gamma. Comparée à la réponse humorale qui diminue considérablement avec le temps, la réponse cellulaire est restée assez stable. Cela pourrait dès lors expliquer pourquoi les individus ayant de faibles titres en anticorps puissent toujours être protégés contre une forme sévère de la maladie
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École d'été Gray-Scott sur le calcul intensif
L'école traitera de l’optimisation des calculs sur différents types de matériels (CPU, GPU), en présentant leurs caractéristiques respectives, architectures et goulots d’étranglements. Il portera d’une part sur les méthodes d’optimisation génériques applicables à tout type de matériel, et d’autre part sur les différentes bibliothèques, technologies et langages dont on dispose pour atteindre la meilleure performance possible. Idéalement, la performance crête de la machine. Matériels envisagés: CPU, GPU.Langages envisagés : C++17, C++20, CUDA, Fortran, Rust, PythonBibliothèques envisagées : SYCL, Eve, Numpy, cunumerics, legate, Jax, Thrust.Compilateurs envisagés : G++, Clang++, nvc++, gfortran, nvfortran, dpc++.Outils de Profilage : Valgrind, Maqao, Perf, NSight, Malt et NumaProfToutes les méthodes seront illustrées sur des exemples simples, comme des produits de Hadamard, des réductions, des calculs de barycentres et des produits de matrice afin d'être appliquées à un problème unique : la simulation d'une réaction de Gray Scott. Ce problème est suffisamment simple pour être compris rapidement et suffisamment complexe pour que les compilateurs aient des difficultés à l’optimiser sans aide. Chaque méthode sera déclinée en version simple, utilisant des options par défaut, et une ou plusieurs versions avancées, qui permettront de discuter et quantifier leurs avantages et inconvénients.Pour plus d'informations sur son contenu, veuillez consulter le site web de l'écoleSur le site satellite de l'Université de Namur, vous bénéficierez des avantages suivants : Interactions avec les formateurs officiels du LAPP ; De l'entraide en groupe et une bonne ambiance de travail ; Un lunch et un drink en fin de journée le premier jour; Vous choisissez ce que vous voulez suivre sur place. Nous vous encourageons à venir le premier jour, mais vous faites votre programme à la carte les autres jours.Pour s'inscrire au site satellite de l'UNamur : https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLScxikCQTfsQl9zZfnidm4xLSuDpdJGcgyLKOfJ2wo4VMgrgRw/viewform
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Défense publique de thèse - Louise GÉRARD
ABCB5 belongs to the ABC transporter superfamily composed of 48 members. These transporters have been extensively studied for their role in cancer multidrug resistance and, more recently, in tumorigenesis. ABCB5 has been identified as a marker of skin progenitor cells, melanoma stem cells, and limbal stem cells. Its expression has also been reported, among other, in melanoma, colorectal cancer, hepatocellular carcinoma and several hematological malignancies. The unique feature of ABCB5 is that it exists as both a full transporter (ABCB5FL) and a half-transporter (ABCB5β). Several studies have shown that the ABCB5β homodimer, in contrast to ABCB5FL, cannot confer multidrug resistance. Since these studies focused on a limited number of drugs, we cannot exclude the possibility that this homodimer may be involved in drug resistance or biological functions that have yet to be elucidated. However, it is also reasonable to hypothesize that ABCB5β could dimerize with other half transporters of the ABCB family to become functional. Using three complementary techniques: (1) nanoluciferase-based bioluminescence resonance energy transfer, (2) coimmunoprecipitation, and (3) proximity ligation assay, we identified two novel heterodimers in two melanoma cell lines: ABCB5β/B6 and ABCB5β/B9. Both heterodimers could be expressed in High-Five insect cells when both interacting partners were fused using the linker region of ABCB1, resulting in chimeric heterodimers. ATPase assays revealed that all chimeric heterodimers have a basal ATPase activity and that both functional nucleotide-binding domains in each dimer are required for their basal ATPase activity. Also, we obtained preliminary data suggesting that ABCB5β traffics from the endoplasmic reticulum to melanosomes independently of its dimerization, suggesting that its heterodimers might be located in similar organelles. However, several limitations were encountered when attempting to confirm their intracellular localization. Finally, since several anti-ABCB5 antibodies in the literature have shown a lack of specificity, we generated a mouse monoclonal anti-ABCB5 antibody in collaboration with Atlas Antibodies. The specificity of this antibody was demonstrated by immunofluorescence, making this antibody an important tool in the characterization of ABCB5β and ABCB5FL. Although further studies are needed to elucidate the physiological relevance of ABCB5β heterodimers, preliminary data support the hypothesis that ABCB5β is involved in melanogenesis. Taken together, these results represent an important step towards elucidating the functional role of ABCB5β in melanocytes and melanoma.
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Journée d’études et d’échanges IRDENA - Etudiants Engagés, Connaissances Vives : Le Nouveau Paradigme Éducatif
La matinée sera marquée par une conférence de Julien Berthaud, spécialiste de l’intégration sociale des étudiants, qui partagera ses apports sur comment cette intégration devient un véritable vecteur de réussite.Ensuite, les communications scientifiques et les partages d’expériences enrichiront nos connaissances et susciteront des débats constructifs. Le déjeuner sera l’occasion de découvrir les projets innovants des étudiants, mis en lumière dans une exposition inspirante.L’après-midi promet d’être tout aussi stimulante avec une table ronde modérée par Sabine Henry, où experts échangeront sur le service learning, l’entrepreneuriat éducatif et la spiritualité. Ce dialogue dynamique sera suivi d’une activité de clôture: la fresque de l’engagement, un brainstorming collectif qui posera les bases d’un jeu éducatif innovant.Rejoignez-nous pour cette journée d’échanges et de réflexion, et contribuez à façonner le futur de l’éducation où l’engagement des étudiants et la vivacité des connaissances seront les pierres angulaires d’un nouveau paradigme éducatif.
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Soutenance publique de thèse - Mahaut BEGHIN
Thèse de doctorat en sciences biologiques
Résumé Nanotechnology is one of the most important fields of innovation in the 21st century. Engineered nanoparticles are used in a wide range of products and industries such as cosmetics, electronics, food packaging, textiles, and even medicine. However, the rapid development of these new materials comes with the challenge of accurately assessing the risks they may pose to human health and the environment. Once released into aquatic ecosystems, nanoparticles are expected to interact with other co-occurring pollutants, including other nanoparticles. However, the effects resulting from exposure to mixtures of nanomaterials on aquatic organisms are rarely known.In this context, the present thesis aimed to assess the effects of exposure to two of the most widely used nanoparticles, zinc oxide (ZnO) and titanium dioxide (TiO2), separately and in a mixture, using a model fish species, the rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). Different approaches were developed to achieve this goal. First, an in vitro model was used to highlight the differences in behavior and toxicity between the individual nanoparticles and their mixture. Rainbow trout were then exposed to environmentally realistic concentrations of the two nanoparticles individually and their mixture. In the first place, the gill's innate immunity and its associated microbiota were studied as they represent the first line of defense of the organism's immune systems, but also because gills represent one of the routes of entrance for nanoparticles in the organism. A stress-on-stress approach was also employed. The trout were challenged with a pathogenic bacterium following the exposure to the nanomaterials to assess their effect on the immunocompetence of the fish.Through this multifaceted approach, this thesis helped provide new insights into the behavior of nanoparticle mixtures and their potential for toxicity. Our findings show that exposure to nanoparticles, usually regarded as having low toxicity potential such as TiO2, may induce toxicological effects when interacting with other nanoparticles.
Jury
Prof. Frédéric SILVESTRE (UNamur), présidentProf. Patrick KESTEMONT (UNamur), promoteur et secrétaireDr Valérie CORNET (UNamur)Prof. Joachim STURVE (University of Gothenburg)Prof. Catherine MOUNEYRAC (Université Catholique de l’Ouest)Prof. Mutien-Marie GARIGLIANI (Université de Liège)
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India China Workshop
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