Acquis d'apprentissage

Au terme de son apprentissage, l’étudiant sera en mesure de:

  • Utiliser de manière appropriée les appareillages et le matériel de laboratoire utilisés en biochimie (balance, pH-mètre, spectrophotomètre, centrifugeuse, pipette, micropipette, cuvette spectrophotométrique, plaque 96 puits, papier pH, pipette Pasteur, verrerie, colonne de séparation, filtre).
  • Préparer une solution d’une concentration définie à partir d’une poudre ou d’un liquide.
  • Réaliser une dilution.
  • Préparer une solution tampon et comprendre son utilité.
  • Réaliser une droite d’étalonnage et un dosage spectrophotométrique.
  • Quantifier l’activité d’une enzyme par dosage spectrophotométrique d’un produit ou substrat.
  • Purifier une protéine d’intérêt par chromatographie par échange d’ion et centrifugation différentielle.
  • Rédiger un compte-rendu d’expérience.
  • Analyser des données brutes expérimentales et les présenter en utilisant un tableur (Excel).
  • Interpréter des données expérimentales et émettre un avis critique sur celles-ci.
  • Développer une capacité de gestion optimale du temps et du travail en binôme.
  • Restituer le nom, le code 1 lettre, le code 3 lettres, la structure, le pKa et la classe (selon la polarité de la chaîne latérale) des acides aminés.
  • Restituer les caractéristiques de la liaison peptidique et savoir dessiner un peptide avec une ionisation correcte en fonction d’un pH défini.
  • Restituer les niveaux de structure des protéines.
  • Comprendre et restituer les principes théoriques des techniques de séparation suivantes: chromatographie par échange d’ion, électrophorèse et chromatographie d’exclusion moléculaire.
  • Connaître les 3 linéarisations utilisées en enzymologie et savoir calculer les constantes cinétiques enzymologiques à partir de ces linéarisations.
  • Identifier le type d’inhibition d’un inhibiteur enzymatique à partir de son impact sur les constantes cinétiques.
  • Elaborer un protocole de dosage enzymologique en choisissant le matériel et la méthode adéquate pour sa réalisation.

Contenu

Seront abordés dans ce cours: 
  • Préparation de solutions et exercices de spectrophotométrie.
  • Caractéristiques structurales des acides aminés et des protéines.
  • Caractéristiques chimiques et techniques de séparation des acides aminés et des protéines.
  • Exercices d’enzymologie.
  • Mise au point d’un protocole d’enzymologie : étude de la cinétique enzymatique de la phosphatase alcaline.

Méthodes d'enseignement

L'étudiant aura à sa disposition:

  • Un syllabus de travaux dirigés.
  • Un syllabus de travaux pratiques.
  • Les supports powerpoints utilisés lors des séances de travaux dirigés.
  • Des vidéos illustrant des points théoriques et/ou pratiques.

Les séances de travaux dirigés ont pour objectif de voir la matière théorique et pratique nécessaire au bon déroulement et à la bonne compréhension des séances de travaux pratiques et au traitement des résultats générés durant ces séances. 

Méthode d'évaluation

 L’UE comprend deux volets : un volet pratique (TP, examen pratique, interrogations, rapports) et un volet théorique (TD, examen théorique). La présence aux séances de TP est obligatoire ; si plus d’un TP n’est pas présenté, l’accès à l’examen pratique hors session sera refusé.


  • Volet pratique : cette partie comporte une séance d’introduction (non cotée), un TP1 (non coté) puis les TP2, TP3 et TP4. L’évaluation prend en compte les interrogations d’entrée, les rapports de fin de TP et l’examen pratique hors session (pas de seconde session). La note du volet pratique (AA pratique) se répartit comme suit : TP2 15 %, TP3 15 %, TP4 15 %, examen pratique hors session 55 %.
  • Volet théorique : cette partie comprend des TD et un examen théorique en session, qui constitue l’intégralité de la note du volet théorique.

Pondération de l’UE : La note finale résulte de la moyenne pondérée des deux volets : pratique 50 % et théorique 50 %. 

Conditions de réussite : Les deux parties, théorique et pratique, doivent être validées (≥10/20) pour valider l'UE. En cas d'échec (≤ 9/20) à l'une des deux parties, volet pratique ou théorique, une note "plafond" de 9/20 sera automatiquement appliquée. La validation du volet pratique est impérative pour valider l’UE ; dans le cas contraire, l’étudiant·e doit représenter l’ensemble des activités d'apprentissage, pratique et théorique. 

Langue d'enseignement

Français