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Soutenance publique de thèse de doctorat en sciences biologiques - Alexis CHASSEUR

JuryProf. Thierry ARNOULD (UNamur), présidentProf. Benoît MUYLKENS (UNamur), secrétaireProf. Sébastien PFEFFER (Université de Strasbourg)Prof. René REZSOHAZY (UCLouvain)Prof. Catherine SADZOT (ULiège)Prof. Dr Benedikt KAUFER (Freie Universität Berlin)Prof. Carine VAN LINT (ULB)Dr Damien COUPEAU (UNamur),RésuméLes ARN existent sous diverses formes dans la cellule : les ARN messagers (ARNm), les ARN de transfert (ARNt) et ribosomaux (ARNr) et les petits ARN régulateurs (ARNsn, miARN, snoARN). Les ARN circulaires (ARNcirc) jouent également un rôle clé en servant de matrice pour la traduction, en inhibant des ARN régulateurs par interaction de séquence, ou en recrutant des protéines pour moduler leur activité.L’herpèsvirus des gallinacés, plus connu sous le nom de virus de la maladie de Marek (MDV), provoque un lymphome agressif chez le poulet, entrainant sa mort dans un délai de quelques semaines. Ceci est dû aux nombreux facteurs de virulence qu’il produit. Notamment, MDV produit un facteur de transcription, Meq, qui induit la transformation des cellules dans lesquelles le gène est exprimé. Ce projet de thèse s’intéresse à un ARNcirc dérivé de ce gène.Cette étude a d'abord identifié de nombreux ARNcirc encodés par MDV, notamment lors de la lymphomagenèse, à partir de quatre principaux locus viraux : l'OriLyt, vTR, LAT et Meq. Le développement du programme vCircTrappist a montré que des virus apparentés encodent également des ARNcirc similaires, reliant la circularisation des transcrits viraux à un mécanisme inconnu.Focalisée sur circMeq, l'étude a révélé que cet ARNcirc atténue la virulence de MDV, en contraste avec le rôle précédemment attribué à Meq. Cette conclusion repose sur l'inhibition sélective de circMeq ou de linMeq via des mutations dans le génome viral.Cette thèse a révélé des propriétés insoupçonnées du gène Meq, ouvrant la voie à des recherches futures, notamment des expériences in vivo pour explorer le rôle de circMeq dans la transmission de MDV. 
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Soutenance publique de thèse de doctorat en sciences mathématiques - Jean-François de KEMMETER

JuryProf. Alexandre MAUROY (UNamur), présidentProf. Timoteo CARLETTI (UNamur), promoteur et secrétaireProf. Malbor ASLLANI (Florida State University)Prof. Renaud LAMBIOTTE (Oxford Mathematical Institute)Prof. Filippo COLOMO (Università degli studi di Firenze)Prof. Christian WALMSLEY HAGENDORF (UCLouvain)RésuméFlocks of birds, people clapping in unison or the World Wide Web are some instances of complex systems in which a large number of entities interact with each other and produce some emergent phenomena. In this thesis, we pay special attention to two such complex systems, namely crowded random walks on networks, and domino tilings and vertex models. In recent years, networks and generalizations thereof have emerged as an efficient tool to model the pattern of interactions among a set of entities. Examples include social networks, transportation networks and ecological networks. A cornerstone of network science is the interplay between network structure and dynamics on networks. Among those dynamical processes, random walks play a central role. In the first part of this thesis, we study the dynamics of multiple random walkers moving across the nodes of the network, assuming the latter to be endowed with limited available space. We characterize, both analytically and numerically, the stationary states, and we subsequently apply the latter framework to a real ecological network. In the second part of the thesis, we move on to the study of the arctic curve phenomenon arising in domino tilings of double Aztec rectangles and configurations of the six-vertex model with partial domain wall boundary conditions. The latter two models manifest in the scaling limit a spatial phase separation between ordered regions and a central disordered region. We compute the arctic curve of the aforementioned models using the tangent method.
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Défense publique de thèse - Nadine HAMDAN

Consanguinity refers to the offspring produced from the union of two closely related individuals who share at least one common ancestor (Temaj et al. 2022). Some communities have high rates of consanguineous marriages, especially in the Middle East, where consanguinity rates of first-cousin marriages vary in Gulf countries from 20 to 50 % (Ben-Omran et al. 2020). This high rate of consanguineous marriages is due to cultural, geographical, historical, financial, political, or religious reasons (Temaj et al. 2022) (Ben-Omran et al. 2020).Consanguinity increases the chance/risk/probability to be homozygous for rare mutations in the general population (Temaj et al. 2022). These mutations can cause recessive autosomal pathologies that may be extremely rare known as rare diseases (Temaj et al. 2022). In many Middle Eastern populations, consanguineous relationships are very common, providing geneticists with a valuable source for discovering "new" genes and identifying their functions (Ben-Omran et al. 2020). Identifying these genes can help carry out diagnostic and predictive tests (genetic counseling) in affected families (Ben-Omran et al. 2020; Temaj et al. 2022). In some cases, understanding the pathophysiological mechanisms involved in diseases can also lead to new therapeutic strategies (Salzberg 2018).In recent years, the development of Next Generation Sequencing (NGS) technologies has led to a faster identification of genes involved in rare diseases (Lal et al. 2016). Sequencing the entire genome (Whole Genome Sequencing, WGS) or the exome (Whole Exome sequencing, WES) can be achieved quickly and inexpensively (Salzberg 2018).Rare diseases are Mendelian monogenic diseases, that result from specific pathogenic variants in single genes, called germline mutations. These mutations occurring in the coding or the non-coding regions in the gene, can be inherited in dominant, recessive, or X-linked transmission modes within a family (Tukker et al. 2021). Coding sequences, known as exons, directly encode the amino acid sequence of proteins essential for various cellular functions, including enzymatic reactions, cell signaling, and structural support. Pathogenic variants within coding sequences can lead to significant disruptions and alterations in the protein structure, function, and stability (Li et al. 2013).  However non-coding sequences that represents around 98% of the entire human genome, include introns, enhancers, promotors, and regulatory elements that regulate genes’ expression. The presence of a pathogenic variant in one of these regions can alter mRNA processing and gene expression and disrupt the delicate balance of gene regulation. REFERENCEWhile coding regions, constitutes around 1 to 2% of the entire genome, , the precise functions of non-coding regions are still unraveled (Moyon et al. 2022).Our project has two main objectives.A) Firstly, to identify the pathogenic variant responsible for a syndromic neurodevelopmental disorder (NDD) in a young boy from a consanguineous Lebanese family. This step was achieved in 2020 and our results were published in Clinical Genetics. Indeed, a homozygous stop gain mutation in the BOD1 gene (p.R151*) was identified and was shown to be involved in the disease observed in this family. BOD1 is a crucial protein that inhibits the PP2A-B56 phosphatase at the kinetochore, which regulates the recruitment of various proteins (such as PLK1: Polo like Kinase 1 ) to ensure proper chromosome orientation during mitosis (Porter et al. 2013). Additionally, BOD1 is a part of a cytosolic variant of the SET1B/COMPASS complex, which affects the expression of genes related to fatty acid metabolism (Wang et al. 2017). Studies in Drosophila have shown that BOD1 depletion in neurons causes synapse morphological abnormalities and learning defects (Esmaeeli-Nieh et al. 2016). Moreover, BOD1 was described to be responsible for ataxic-like behaviors in mice with conditional in what tissue? Knock-Out (KO) of exon 2 of this gene in the lobes IV-V of the cerebellum  (Liu et al. 2022). On another note, a homozygous nonsense mutation in BOD1 gene (p.R112*) was identified in two related Iranian females, who were diagnosed with moderate form of ID (Intellectual Disability) and primary/secondary amenorrhea (Esmaeeli-Nieh et al. 2016).B) Secondly, we aimed to study the effect of the p.R151* mutation in BOD1 gene on protein expression. To achieve this, we used the CRISPR-Cas9 genome editing technique to create a knock-in (KI) of the mutation in HEK293T cells. We then analyzed the effect of this mutation on the expression of Bod1 protein using Western blot technique. Furthermore, we wanted to investigate the physiological and developmental function of the BOD1 gene. For this purpose, we have generated a conditional knock-out cKO mouse model.
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Journée scientifique FNRS-EDT-CHIM

Cet événement est ouvert à tous, jeunes et seniors, partenaires académiques et industriels, avec une priorité aux doctorants pour les conférences. Nous souhaitons encourager les directeurs de thèse à faire de cet événement un succès en invitant tous leurs étudiants à y participer. La langue de la réunion sera l'anglais.   Trois orateurs principaux sont prévus :Vincent Rodriguez (Université de Bordeaux, France) | Utilisation de la lumière polarisée linéairement pour sonder l'activité chiroptique non linéaire des molécules et des foldamères d'oligoamides aromatiquesProf. Tatjana N. Parac-Vogt (KU Leuven) | Enzymes artificielles basées sur des grappes d'oxydes métalliques : des espèces discrètes aux matériaux étendusChristophe Copéret (ETH Zürich, Suisse) | Contenu préliminaire « Moitié catalyse et moitié RMN ». Différents créneaux pour 10 short talks (15 mins de présentation + 5 mins de Q/A) ainsi que 10 flashs posters (2 mins) seront disponibles pour les doctorants. Les doctorants et les chercheurs post-doctorants auront également la possibilité de présenter leurs travaux lors de sessions de posters. Les meilleures présentations orales et affichées seront récompensées.La participation est gratuite mais l'inscription est obligatoire via ce formulaire... 
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50 ans de microscopie électronique à l’UNamur

Au programme 16h00 | Accueil des participants dans le hall de la Faculté de médecine16h30 | Séance anniversaire et inaugurale17h30 | Drink et visite (en groupe) des laboratoiresParticipation externe sur invitation. Une question ?  Contacter Jean-François Colomer : jean-francois.colomer@unamur.be 
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1st Global Chinese Materials Conference (GCMC2025)

The conference is co-organized by the University of Namur, Belgium and Wuhan University of Technology, China and supported by Foshan Xianhu Laboratory and other organisms.More info on the GCMC2025 website...
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PiDay 2025 : Une matinée pour découvrir le monde fascinant des mathématiques ! (Complet)

Quand : Mercredi 12 mars 2025 de 9h à 12hCombien : GratuitLangue : FrançaisPublic : 5-6ème secondaireLieu de RDV : Confluent des Savoirs · UNamur – Rue Godefroid 5, 5000 Namur.Au programme, des mini-conférences et des ateliers :8h30-9h00 : Accueil des groupes9h00-9h40 : Alexandre Mauroy (UNamur) · Un monde sans maths : c’est le PI-ed ou ça fait PI-tié ?A ton avis, comment serait un monde sans les maths ? Ce serait sans doute un peu moins amusant si tu fais des maths comme on joue au sudoku. Ou ce serait beaucoup plus fun si, au contraire, tu ne les aimes pas trop… Mais en fait, est-ce que les maths se résument à un jeu intellectuel pour certains et une torture de l’esprit pour tous les autres ? Sont-elles vraiment utiles dans la vie réelle ? Nous tenterons de répondre à ces questions et découvrirons ensemble comment les maths se retrouvent dans notre quotidien. Alors, un monde sans maths, c’est le pied ou ça fait pitié ? A toi de décider !9h40-10h20 : Timoteo Carletti (UNamur) · 𝜋, Connectivité et Réseaux : Un Cercle Sans FinOn parle de réseaux sociaux, comme Facebook ou TikTok, mais aussi de réseaux de transports, par exemple train, avion, voitures, … Pourquoi utiliser le même mot ? A ton avis, qu’est-ce qu’ils ont en commun ces “réseaux” ? Ensemble nous allons découvrir l’objet mathématique réseau, ses propriétés et son utilisation bien au-delà des cas ci-cités. On verra qu’on peut utiliser un réseau pour analyser une BD ou un roman, ou encore proposer une nouvelle façon d’écrire la musique.10h20–10h40 : Pause10h40-11h40 : Trois ateliers en parallèle - chacun de 20 minutes.1) Des maths pour dessinerEst-il possible de reproduire n’importe quelle image en un trait continu, sans lever le stylo ? Dans cet atelier, nous utiliserons les maths pour y parvenir avec l’aide d’une imprimante 2-axes.2) Des maths pour contrôler des robotsNous allons découvrir ensemble comment agir, grâce aux mathématiques, sur des systèmes complexes tels que des robots (roulants ou volants) afin qu’automatiquement, ils réalisent une tâche donnée.3) Des maths pour étudier des robots sociauxNous allons montrer comment les maths permettent d’étudier le comportement d’un groupe de robots sociaux qui peuvent communiquer entre eux et réaliser une tâche fixée. Cette activité est organisée avec le soutien de la Wallonie Recherche Découvrez la programmation en Wallonie et à Bruxelles
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L’eau, un bien commun à préserver

A quelques jours de la Journée mondiale de l’eau et du Printemps des Sciences 2025, nous vous invitons à une conférence inaugurale sur la thématique de l’eau comme bien commun. Dans une société marquée par les crises et les dérèglements climatiques, réaffirmer la place de l’eau comme “bien commun” pourrait être une voie prometteuse pour mieux préserver ce patrimoine collectif si précieux.4 expert·e·s aux profils variés viendront partager leurs perspectives pour éclairer cet enjeu crucial.Au programme :Mots d’introduction et de bienvenue : Adrien Dolimont, Ministre-Président de la Wallonie et Ministre en charge de la Recherche Annick Castiaux, Rectrice de l’Université de NamurNicolas Velings, Directeur du Département des Sciences, des Technologies et du Vivant de la Haute Ecole Louvain en Hainaut et Président de Synhera  Table-ronde animée par Anne-Sophie Bruyndonckx, avec :Nicolas Brasero, Coordinateur du Contrat de Rivière Haine ASBLAurore Degré, Professeure de physique des sols et d’hydrologie et Vice-Doyenne à l’Enseignement à l'ULiège – Gembloux Agro-Bio TechPatrick Kestemont, Professeur ordinaire de la Faculté des Sciences de l'UNamur, Directeur du laboratoire de Physiologie et Toxicologie Environnementale, Institut de Recherche Life, Earth & EnvironmentLaura Rizzerio, Philosophe, Professeure à l'UNamur, Directrice du Centre Universitaire Notre-Dame de la Paix et membre de l'Institut ESPHINEchanges avec le publicLe Printemps des Sciences est LE rendez-vous incontournable de la culture scientifique et technologique (STEM) en Wallonie et à Bruxelles. L’édition 2025, qui se déroulera du 24 au 30 mars 2025, a pour thème “Eau-rêka”.
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Soutenance publique de thèse en sciences biologiques - Martin Vastrade

La défense aura lieu dans l'auditoire M21 (bâtiment 6), accessible via la Cour des Cercles au 3, rue Joseph Grafé.  Elle sera suivie d'un drink, qui prendra place dans l'Espace Bauchau (bâtiment 22), également accessible via la Cour des Cercles au 3, rue Joseph Grafé."Evolution and consequences of androgenesis in the invasive clam genus Corbicula".Chez la plupart des Eucaryotes, la reproduction sexuée implique la production de gamètes réduits par méiose canonique, suivie d’une fécondation pour restaurer la ploïdie parentale et produire une progéniture génétiquement variable. Cependant, différents modes de reproduction ont émergé indépendamment et à plusieurs reprises chez les Eucaryotes, montrant de diverses modifications des mécanismes de la gamétogenèse pour produire une descendance qui restaure ou maintient la ploïdie parentale sans méiose canonique. Parmi eux, plusieurs modes de reproduction asexuée impliquent encore la méiose et la fécondation, mais seul le génome paternel ou maternel est transmis à la génération suivante. L'un de ces modes de reproduction est l'androgenèse, dans lequel la progéniture hérite uniquement de l'entièreté du génome nucléaire paternel, tandis que les chromosomes nucléaires maternels sont perdus par divers processus. Ce mode de reproduction permet une transmission clonale du génome paternel à la descendance, tandis que le génome nucléaire maternel n'est pas transmis. Dans la plupart des cas, le génome mitochondrial de l'ovocyte est néanmoins transmis. L'androgenèse est considérée comme du parasitisme sexuel où les ovules des femelles sont des ressources utilisées par les mâles pour propager leurs gènes. Ce parasitisme sexuel peut même se produire entre espèces distinctes.Bien que l'androgenèse soit un mode de reproduction rare dans la nature, il est répandu chez les palourdes du genre Corbicula. Ce groupe de bivalves présente des caractéristiques reproductrices complexes : le mode de reproduction peut être sexué, impliquant des spermatozoïdes uniflagellés, ou androgénétique, avec la production de spermatozoïdes biflagellés non réduits ; le niveau de ploïdie varie de la diploïdie, triploïdie, ou tétraploïdie ; le système sexuel inclut le gonochorisme strict, l'hermaphrodisme simultané, l'androdioécie, la trioécie, voire l'hermaphrodisme séquentiel et la gynodioécie ; enfin, leurs stratégies d'incubation des larves incluent l'oviparité, l'ovoviviparité ou la viviparité. Étonnamment, alors que les lignées androgénétiques de Corbicula sont abondantes en Asie, en Afrique et en Océanie, et envahissantes en Amérique et en Europe, les espèces sexuées restent restreintes à quelques localités dans leur aire de répartition native.En raison des traits de vie inhabituels des palourdes Corbicula, leur taxonomie est non résolue et la définition des espèces est complexe dans ce groupe. Les lignées androgénétiques peuvent utiliser les ovocytes d'autres espèces pour se reproduire, entraînant un « mismatch cytonucléaire » : le génome nucléaire d'une espèce est combiné avec le génome mitochondrial d'une autre espèce dans la progéniture. Dans certains cas, le génome maternel est partiellement transmis, conduisant à la formation de zygotes polyploïdes avec les génomes nucléaires paternel et maternel. Lorsque cela se produit entre différentes espèces de Corbicula, ce phénomène conduit à la formation d'hybrides, brouillant ainsi la délimitation des espèces dans ce taxon.Le genre Corbicula est un modèle unique pour étudier l'évolution des caractéristiques reproductrices chez les animaux. Le présent travail aborde des questions sur l'évolution de l'androgénèse, la sexualité occasionnelle, la délimitation des espèces, les hybridations et l'invasion biologique.Membres du juryPr. Karine Van Doninck (Promotrice, Université Libre de Bruxelles)Dr. Jonathan Marescaux (Co-promoteur, e-biom)Pr. Thierry Backejau (Royal Belgian Institute of Natural Sciences)Pr. Alice Dennis (Université de Namur)Pr. Jean-François Flot (Université Libre de Bruxelles)
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International Spring School «Innovation for sustainable food systems: Shaping the future of nutrition and health »

Cet événement sera consacré aux progrès en matière d'alimentation, de nutrition et de santé dans le cadre d'un système allant de la ferme à la table. Des sessions plénières, des ateliers et des visites de centres de recherche et d’universités seront également organisés. Cet événement unique sera l'occasion :D'explorer des solutions durablesDe découvrir l'expertise scientifique de la Wallonie,D'accéder aux dernières recherches et innovations dans le secteur,D'échanger avec des experts internationaux et développer votre réseau,De collaborer à des projets concrets pour avoir un impact positif et durable.2 jours avec plus de 150 participants internationaux et entreprises belges. L'inscription est gratuite mais obligatoire.Plus d'infos, inscriptions et programme complet ICI ! 
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Space Week Namur

Entrez dans l’univers fascinant de la Space Week Namur 2024 ! Préparez-vous à un voyage extraordinaire à travers les étoiles et les mystères de l’espace. Voici le programme de cette semaine cosmique : Expositions “Objectif étoiles” : Avec cette exposition d'astrophotographie, plongez dans un océan d’étoiles scintillantes et laissez vous émerveiller par les secrets de notre galaxie. “Stellar Scape” :  Une aventure immersive où l'art et les sciences vous transporteront au cœur des paysages stellaires, où chaque étoile raconte une histoire. Événements "Mission ISS : Improvisation Space Station" :  Un spectacle de l’ImproNam, le kot-à-projet namurois d’improvisation théâtrale."Rencontre des astronautes" : Une chance unique pour les jeunes explorateurs de rencontrer des héros de l’espace et d’écouter leurs récits d’aventures au-delà de notre monde. “Mercredi des Savoirs” : Des ateliers interactifs pour les jeunes esprits curieux, prêts à découvrir les merveilles de la science.“Chill & Sciences” : Un moment convivial pour discuter avec un chercheur et un artiste, et explorer les mystères de l’univers. "Premier contact - Arrival" : Un ciné-rencontre proposé par le Caméo et Le Pavillon. "5 ans de l'Observatoire astronomique Antoine Thomas"Visites Visite de l’Observatoire astronomique Antoine Thomas : Une expédition guidée pour percer les secrets de l’observation astronomique et contempler les merveilles du cosmos. Ne manquez pas cette opportunité de plonger dans un univers fantastique et de partager des moments inoubliables avec des passionnés de tous horizons. Rendez-vous à Namur du 7 au 12 octobre 2024 pour la Space Week ! 🚀✨  Cliquez ici pour télécharger le programme et pour vous inscrire aux activités
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Soutenance publique de thèse de doctorat en Sciences chimiques - Amélie MAERTENS

Jury Prof. Benoît CHAMPAGNE (UNamur), présidentProf. Carmela APRILE (UNamur), secrétaireProf. Eric GAIGNEAUX (UCLouvain)Prof. Sonia FIORILLI (Politecnico di Torino)Prof. Wouter MARCHAL (UHasselt) Abstract Heterogeneous acid catalysts became over the years essential to our modern industrial world. Among the possible forms of solid materials with acidic properties, porous silica-based structures embedding active single-sites showed highly promising catalytic activity for various reactions. The insertion of heteroelements inside the SiO2 network is known to introduce a combination of Brønsted and Lewis acid sites which depends on the nature of the element and influences the catalytic properties of the solid. The present thesis investigates the link between the Brønsted/Lewis acid balance introduced by different elements (Al, Ga, In, Ti, Zr, Hf) inserted or finely dispersed in/onto the structure of extra-small silica nanospheres and the catalytic performances of the solids for two distinct biomass derivatives valorization reactions (i.e. conversion of glycerol to solketal and of ethyl levulinate to γ-valerolactone).The optimizations of the syntheses were particularly focusing on the insertion of the element inside the SiO2 matrix to maximize the number of acid sites. In-depth characterizations were conducted on the different substituted nanospheres to probe their morphological, structural, and textural features. A special attention was dedicated to the characterization of the surface acidity. These results were put into perspective with the catalytic performances of the materials. At the end of the investigations, we were able to explain the difference in terms of catalytic activity between the different studied solids and identify the optimal acid properties for the targeted reactions. The stability and recyclability of the best working solids were also assessed, an acute tuning of reaction conditions enabled to reach significatively high conversions, and their performances were tested in challenging conditions (i.e. close to crude feedstock).The knowledge unveiled through these investigations will give precious insight to design new silica-based catalysts with the appropriate acidity for a wide variety of acid-catalyzed reactions.
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