Les étudiants découvriront les techniques de microscopie permettant d'aborder des questions clés sur l'homéostasie de la voie de sécrétion en biologie cellulaire. Ils apprendront les éléments clés à prendre en compte lors de la planification et de la réalisation d'expériences, ainsi que la manipulation des données pour la création de figures, l'analyse et la discussion des résultats.
À l'issue du cours, les étudiants :
i) Avoir une compréhension de base de l'application de différentes techniques de microscopie pour étudier l'homéostasie et le contrôle qualité du trafic protéique
ii) Comprendre l'importance du trafic protéique pour l'homéostasie cellulaire et dans le contexte des maladies
iii) Comprendre les enjeux liés au ciblage pharmacologique du trafic protéique
iv) Savoir traiter un jeu de données, depuis les images brutes jusqu'à la réalisation d'une figure de qualité publiable
v) Avoir des notions sur la quantification d'images
vi) Être capable de discuter des données de microscopie et de rédiger une section « Résultats »
Ce cours porte sur l'application de la microscopie à l'étude du trafic protéique et de la biologie cellulaire, tant dans des conditions physiologiques que pathologiques. Le programme comprendra:
i) des exemples d'utilisation de diverses techniques de microscopie pour aborder des questions de pointe en biologie cellulaire, incluant des séminaires animés par des conférenciers invités auteurs de publications majeures
ii) des séminaires illustrant le rôle du trafic protéique dans la santé et la maladie
iii) les approches permettant de moduler le trafic protéique, ainsi que leurs effets sur l'homéostasie cellulaire et leur pertinence dans le contexte de maladies
iv) l'utilisation de la microscopie dans la recherche sur le trafic protéique
v) une démonstration en direct d'une technique de trafic très répandue, le système RUSH, sur un microscope à disque rotatif (spinning disk)
vi) les méthodes de quantification d'images, de préparation de figures et d'interprétation des résultats, incluant une intervention d'un expert en imagerie de l'Institut Curie (Paris).
Accès à un ordinateur portable avec le logiciel gratuit FIJI/ImageJ (https://imagej.net/software/fiji/) et à un éditeur de graphiques matriciels, nécessaire pour la seconde partie du cours (option : essai gratuit de 30 jours). Je recommande le logiciel Affinity (photo et design) (https://affinity.serif.com/en-gb/photo/?srsltid=AfmBOoplc6qGkxgsYeke-jN…) ou Adobe Photoshop/Illustrator. Les versions gratuites peuvent présenter des difficultés de compatibilité entre les logiciels, mais elles sera suffisant pour ce cours. En dernier recours, PowerPoint est une option.
Le module comprendra trois approches pédagogiques différentes :
i) Des conférences présentant des recherches de pointe sur l'homéostasie, le contrôle qualité et la voie de sécrétion, ainsi que l'intégration de la microscopie par les auteurs.
ii) Une démonstration en direct d'un test de trafic courant, RUSH, par microscopie à disque rotatif.
iii) Des explications et des ateliers sur la quantification des images microscopiques, la réalisation de figures et la discussion des résultats.
Durant le cours, les étudiants seront notés sur leur engagement, par exemple leurs questions aux enseignants, leur implication lors des cours, etc. À la fin du cours, ils remettront un court rapport écrit reprenant les techniques étudiées pendant le module. Basé sur l'expérience RUSH observée lors d'une séance, ce rapport comprendra:
• Objectifs
• Figure
• Quantification d'images
• Résultats
La pondération des notes sera de 25:75 (engagement:rapport).
| Formation | Programme d’études | Bloc | Crédits | Obligatoire |
|---|---|---|---|---|
| Master 120 en sciences biomédicales | Filière en gestion de la recherche clinique | 1 | 3 | Non |
| Master 60 en sciences biologiques | Standard | 1 | 3 | Non |
| Master 120 en biochimie et biologie moléculaire et cellulaire | Finalité approfondie | 1 | 3 | Non |
| Master 120 en biochimie et biologie moléculaire et cellulaire | Finalité spécialisée | 1 | 3 | Non |
| Master 120 en sciences biomédicales | Filière en recherche fondamentale et préclinique | 1 | 3 | Non |
| Master 60 en sciences biomédicales | Standard | 1 | 3 | Non |