Le Département de Médecine se compose des laboratoires suivants :
- Laboratoire d'Anatomie
- Laboratoire d'Appui à l'enseignement clinique
- Laboratoire de Biologie du Trafic Intracellulaire (membre de l'URPhyM)
- Laboratoire Cellules et Tissus (membre de l'URPhyM)
- Laboratoire Neurodégénérescence et Régénération (membre de l'URPhyM)
- Laboratoire de Physiologie générale (membre de l'URPhyM)
- Laboratoire de Physiologie et Pharmacologie (membre de l'URPhyM)
- Laboratoire de Physiologie respiratoire (membre de l'URPhyM)