Biomolecular Complexes
Biomolecular Complexes
Selected Publications (2001- )
Reduced point charge models of proteins: Assessment based on molecular dynamics simulations, Leherte, L. Molecular Simulation. 42 (2016) 289-304
Modeling of structural, energetic, and dynamic properties of few-atom silver clusters embedded in polynucleotide strands by using molecular dynamics, Staelens N., Leherte L., Champagne B. & Vercauteren D.P., ChemPhysChem 16 (2015) 360-369
Evaluation of reduced point charge models of proteins through Molecular Dynamics simulations: Application to the Vps27 UIM-1 – Ubiquitin complex, Leherte L. & Vercauteren D.P. Journal of Molecular Graphics and Modelling 47 (2014) 44-61
Protein-protein docking using three-dimensional reduced representations and based on a genetic algorithm, Becue A. , Meurice N. , Leherte L. & Vercauteren D. 2008 In: Models, Mysteries, and Magic of Molecules. Boeyens J.C.A. & Ogilvie J.F. (eds.). Guildford: Springer, p. 301-323
Evaluation of the protein solvent-accessible surface using reduced representations in terms of critical points of the electron density, Becue A., Meurice N., Leherte L. & Vercauteren D.P. Journal of Computational Chemistry 25 (2004) 1117-1126
Description of protein-DNA complexes in terms of electron-density topological features, Becue A., Meurice N., Leherte L. & Vercauteren D.P. Acta Crystallographica D 59 (2003) 2150-2162
PhD Theses
R. Cosquer, Theoretical study of opioid receptor self-assembly by hybrid methods to elaborate bitopic ligands (in progress) Cosquer R.
Développement d'une méthode originale d'algorithme génétique pour l'étude de la complémentarité entre partenaires macromoléculaires protéine-protéine et protéine-acide nucléique (2004) Becue A.
Master Theses
Study of the CD2/CD58 protein-protein interface with the perspective to elaborate new ligands (in progress) Petit A.
"Docking" moléculaire par algorithme génétique basé sur des représentations en terme de points critiques de la densité électronique (2000) Becue A.
Elaboration d'un algorithme génétique original pour l'étude de la complémentarité de systèmes ligands/récepteurs. Cas de la transcriptase inverse du SIDA et de ses inhibiteurs non-nucléosides (1999) Anrys S.
Simulation théorique d'images STM par modélisation moléculaire. Etude des interactions entre graphite et lipides (acide gras, esters de cire, phospholipide) (1998) Rinchart C.
